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然而实际应用情况并非如此，原因与伺服系统控制有关。要弄清原因，需要先看一下老式的轴驱动包装线。它们也许并不灵活或精确，但机械连接使得它们具有可预见性。一个使用阶梯逻辑的可编程逻辑控制器使一个功能紧接着另一个功能，这是一个相对容易确认的系统。
但同时，伺服系统是独立运行的模块，它们依靠软件而不是齿轮、链条和凸轮来完成其任务。许多软件使用基于PC的处理器，这既是它们的强大之处，也是它们脆弱的地方。一方面，个人计算机使得拖放式和触摸屏控制成为可能。它们支持先进的数据采集、传输和分析，也支持21 CFR Part 11法规所遵从的查账审核的综合需求。但不足之处是，这些强大的地方也是个人计算机脆弱的地方。PC不像PLC阶梯逻辑，计算机可以在同一个时间做10个不同的事情，因此，当这些功能同时进行时，确认一台机器是一个挑战。
制药设备必须在每个单一时间内以同样的方式运转。不是三条路，而是只能有一条路来造出产品。对个人计算机系统的关注在于：是否能够做到，一条路错了，计算机会发现另一条路而绕过它。而对于台式计算机的蓝屏死机现象，很多企业都很害怕这种事故重复发生。
